Jurassic World: Hakimiyet olaylarından 5 yıl sonra, gezegenin ekolojisinin dinozorlar için büyük ölçüde uygun olmadığı kanıtlanmıştır. Hayatta kalanlar, geçmişte geliştikleri ortamlara benzer iklimlere sahip, izole ekvator bölgelerinde varlıklarını sürdürmektedir. Bu tropik biyosferde, kara, deniz ve havada yaşayan üç devasa yaratık, DNA'larında insanlık için mucizevi hayat kurtarıcı faydalar sunabilecek bir ilacın anahtarını taşımaktadır.Scarlett Johansson, genetik materyali güvence altına almak amacıyla son derece gizli bir göreve liderlik etmek için seçilen yetenekli gizli operasyon uzmanı Zora Bennett karakterine hayat veriyor. Ancak Zora’nın ekibi, görev sırasında, tekneleri başıboş dolaşan su dinozorları tarafından alabora olan sivil bir aileyle karşılaşınca işler değişir. Hepsi, bir zamanlar Jurassic Park için gizli bir araştırma tesisine ev sahipliği yapmış, yasaklı bir adada mahsur kalır.Bu ıssız adada, farklı türlerden dinozorların yaşadığı geniş arazilerde ilerlerken, dünyadan on yıllardır saklanan karanlık ve sarsıcı bir keşifle yüzleşmek zorunda kalırlar…

Film, 1969'da NASA'nın tarihi Apollo 11 Ay’a inişinin tehlikeli arka planında geçiyor. NASA'nın kamuoyundaki itibarını iyileştirmek için görev alan pazarlama uzmanı Kelly Jones, fırlatma direktörü olan Cole Davis'in zaten zor yürüyen görevini tamamen alt üst eder. Beyaz Saray bu görevin başarısız sonuçlanmayacak kadar değerli olduğuna karar verince Jones, destek amacıyla sahte bir Ay’a iniş planlamakla görevlendirilir ve geri sayım başlar.